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Introducción. Las infecciones respiratorias agudas, son la causa más frecuente de morbilidad y mortalidad a nivel mundial, estas constituyen la principal causa de hospitalización en pediatría, Objetivos. Identificar la circulación de agentes etiológicos en la población menor de un año durante el 2013; determinar la asociación entre la circulación de los diferentes virus con la edad en meses y analizar la asociación de estos virus con el diagnostico clínico. Metodología: Estudio observacional descriptivo Se analizaron 1086 muestras clínicas procedentes de la vigilancia epidemiológica nacional durante el año 2013. Se detectaron 17 virus respiratorios mediante tres PCR-anidadas y una PCR en tiempo real. Se seleccionaron las variables de estudio. Se calculó la oportunidad relativa (OR) se consideró significativo valores superiores a 1 con un intervalo de confianza de 95%. Resultados. Se encontró una prevalencia a la infección viral de 63.2%. El Virus Sincitial Respiratorio A fue el de mayor prevalencia seguido por el Rv. Para la edad de 3 meses se obtuvo un OR de 2.40 y valor de p <0.000 1con el Virus Sincitial Respiratorio A, y se observó una inicidencia mayor en los meses de agosto a noviembre; constituyó un agente etiológico importante en la IRA grave y la bronquiolitis. El rinovirus participó como agente etiológico en la IRA grave y la bronquiolitis La circulación de la Influenza A/ H1N1pdm09 solo se detectó en la IRA grave y en la Enfermedad tipo influenza (ETI) en esta última con un OR de 5.83 y p<0.0001. Conclusiones: La circulación del VSR A y B se relacionó con en el primer trimestre de vida se demostró su asociación con la IRA grave y bronquiolitis. Se comprobó la circulación endémica del Rv, su participación en la bronquiolitis y la IRA grave, la circulación de la influenza A/H1N1 pdm09 no fue relevante al igual que el resto de los virus encuestados.